Гистологический анализ проводится для образцов тканей с целью выявления различных паталогий. Анализ может проводиться как на живой ткани (суправитально), так и на фиксированном с помощью различных методов образце.
При суправитальных исследованиях образцы ткани выращиваются на специальных питательных средах, позволяющих воссоздать тканевые структуру и функции. Также применяют имплантацию образца в прозрачные среды организма (например, переднюю камеру глаза). Существует метод биологического окна, когда для наблюдения в ткань вживляется прозрачная среда, которая затем исследуется под микроскопом.
При исследовании изъятого (обычно с помощью биопсии) образца применяются различные методы его фиксации, позволяющие сохранить структурные и функциональные особенности. К таким методам относятся химическая или температурная (замораживание) фиксация с последующим срезом или сколом. Иногда применяют химическое прокрашивание для выделения отдельных структур ткани или декальцинию для удаления твёрдых фрагментов.
Гистологические исследования выявляют инфекционные и опухолевые заболевания, нарушения кровообращения и другие паталогии по морфологическим изменениям, происходящим в тканях организма. Назначаются врачом при наличии достаточных оснований, так как забор материала для исследования зачастую сопряжён с большим риском.